С напредването на историята обаче възниква напрежение, когато избрана група прасета започва да манипулира и експлоатира своите събратя. Конфликтът се задълбочава, когато прасетата, водени от хитрия и авторитарен глиган Наполеон, започват да променят Седемте заповеди - ръководните принципи на фермата - за да обслужват собствените си интереси.
Наполеон и неговите събратя прасета постепенно поемат лидерски роли и установяват йерархична система, която ги поставя над другите животни. Това води до дълбоко разделение в общността на животните, тъй като Наполеон и неговите поддръжници се радват на привилегии и лукс, докато останалите животни се трудят за издръжката на фермата.
Конфликтът се върти около стремежа на прасетата за власт и борбата на другите животни да запазят идеалите на първоначалния си бунт. В крайна сметка изследването на Animal Farm на предизвикателствата при насърчаването на истинското равенство се превръща в критика на тоталитарните общества и покварата на привидно благородни идеологии.