Подобрители:Това са ДНК последователности, които свързват транскрипционните фактори и насърчават транскрипцията на близките гени. Например, усилвателят в локуса на имуноглобулинова тежка верига е отговорен за високото ниво на експресия на тези гени в В клетките.
Промотори:Това са ДНК последователности, които свързват РНК полимеразата и инициират транскрипцията на гени. Например, промоторът в гена на човешки растежен хормон е отговорен за експресията на този ген в хипофизната жлеза.
Заглушители:Това са ДНК последователности, които свързват транскрипционните фактори и потискат транскрипцията на близките гени. Например, заглушителят в човешкия β-глобинов ген е отговорен за потискането на този ген в нееритроидните клетки.
Трансактивни последователности:
Транскрипционни фактори:Това са протеини, които се свързват с цис-действащи последователности и регулират транскрипцията на гени. Например, транскрипционният фактор Oct-1 се свързва с октамерния мотив в усилвателя на тежката верига на имуноглобулина и подпомага транскрипцията на тези гени в В клетките.
РНК полимераза:Това е протеинов комплекс, който се свързва с промотори и транскрибира гени в РНК.
Други регулаторни протеини:Това са протеини, които се свързват с цис-действащи последователности и регулират транскрипцията на гени по различни начини. Например, протеинът CTCF се свързва с CCCTC мотива в човешкия β-глобинов ген и помага да се организира хроматиновата структура на този регион, което е необходимо за репресията на гена в нееритроидните клетки.