Бащата на микроскопията е Антон ван Льовенхук, холандски търговец и учен, който е най-известен с пионерската си работа в областта на микроскопията и откритията си на микроорганизми. Той е първият, който наблюдава и описва бактерии, протозои, сперматозоиди и други микроскопични организми. Льовенхук направил свои собствени микроскопи чрез шлифоване и полиране на малки стъклени сфери, които използвал за постигане на увеличения до 270 пъти. Той прави подробни чертежи и описания на своите наблюдения, които публикува в поредица от писма до Кралското общество в Лондон. Работата му постави основите на областта на микробиологията и оказа дълбоко въздействие върху нашето разбиране за естествения свят.