- BWV 147 "Сърце и уста, баща и живот"
- BWV 140 "Внимавай, помириши гласа ни"
- BWV 198 "Бавно, първо, бавно още една стъпка"
Страстни оратории:
- Страстите по Матей, BWV 244
- Страстите по Йоан, BWV 245
Меси:
- Меса в си минор, BWV
- Меса в сол минор, BWV
Оратории:
- Великденска оратория, BWV 249
- Коледна оратория, BWV 248
Оркестрови сюити:
- Оркестрова сюита No. 1 в до мажор, BWV
- Оркестрова сюита No. 2 в си минор, BWV
- Оркестрова сюита No. 3 в ре мажор, BWV
- Оркестрова сюита No. 4 в ре мажор, BWV
Сонати и части за соло цигулка:
- Част № 1 в си минор, BWV
- Част № 2 в ре минор, BWV
- Част № 3 в ми мажор, BWV
Сонати и части за соло виолончело:
- Сюита за виолончело No. 1 в Сол мажор, BWV
- Сюита за виолончело No. 2 в ре минор, BWV
- Сюита за виолончело No. 3 в до мажор, BWV
- Сюита за виолончело No. 4 в ми бемол мажор, BWV
- Сюита за виолончело No. 5 в до минор, BWV
- Сюита за виолончело No. 6 в ре мажор, BWV
Концерти:
- Бранденбургски концерт №. 1 във Фа мажор, BWV
- Бранденбургски концерт №. 2 във фа мажор, BWV
- Бранденбургски концерт №. 3 в Сол мажор, BWV
- Бранденбургски концерт №. 4 в Сол мажор, BWV
- Бранденбургски концерт №. 5 в ре мажор, BWV
- Бранденбургски концерт №. 6 в Си бемол мажор, BWV
Клавиатурата работи:
- Добре темперираният клавир, книги 1 и 2, BWV 846-8
- Вариациите на Голдбърг, BWV 988
- Френски сюити, BWV 812-817
- Английски сюити, BWV 806-811
- Части, BWV 825-830
Други произведения:
- Музикалното предложение, BWV 1079
- Изкуството на фугата, BWV
- Хорове, BWV 250-438