„Убийство в Ориент Експрес“ навлиза в темата за идентичността и нейната сложност. Романът представя няколко героя с различен произход, култура и дневен ред, всеки от които крие скрита самоличност или носи тайни. Поаро, детективът, трябва да погледне отвъд повърхността, за да определи истинските характери и мотивации на пътниците.
Темата за справедливостта също играе важна роля в историята. Поаро се стреми не само да разкрие престъплението, но и да осигури справедливост. Пътниците са изправени пред етична дилема, когато се събират, за да решат съдбата на убиеца. Те трябва да решат дали да следват строги законови процедури или да вземат нещата в свои ръце, за да постигнат чувство за справедливост, което смятат за необходимо.
Романът повдига интригуващи въпроси за сложността на човешката идентичност, неяснотата на морала и търсенето на истина и справедливост.