Планът започва с това, че Сайръс използва силата на мощния легендарен покемон Креселия и Даркрай. Твърди се, че Cresselia контролира лунната сила и може да изпълнява желания, докато Darkrai се свързва с тъмнината и кошмарите. Като комбинира техните способности, Сайръс възнамерява да създаде света на изкривяването и да промени реалността.
За да задействат плана си, Галактическата империя търси контрол над региона Синно, където се твърди, че живеят Креселия и Даркрай. Те създават различни бази в Sinnoh и участват в битки срещу героя на играча и неговия отбор. Едно от забележителните им скривалища е галактическият щаб във Veilstone City, който служи като основен център за техните операции.
Докато играчът напредва в играта, той среща членове на Галактическата империя и разкрива техните планове. Кулминационният момент настъпва, когато играчът стигне до тайното скривалище на Team Galactic, Spear Pillar, където Cyrus се опитва да създаде света на изкривяването.
Играчът трябва да се сблъска с предизвикателни битки срещу Галактически мрънкачи, Командири и дори самия Сайръс. Ако успее да победи Cyrus, играчът може в крайна сметка да предотврати завършването на своята схема и да възстанови мира в региона Sinnoh.
Гениалният план в Pokemon Light Platinum служи като централен разказ, движещ сюжета на играта и поставя сцената за епично приключение, изпълнено с битки, пъзели и срещи с легендарния покемон.