Абстрактният конфликт в историята се крие във вътрешната борба на Браун да запази вярата си пред лицето на злото и покварата, на които е свидетел в гората. Той среща фигури като дявола, който представлява изкушението и греха, както и други сенчести и мистериозни герои, които символизират по-тъмните аспекти на човешката природа. С напредването на историята Браун става все по-конфликтен и объркан, поставяйки под въпрос собствената си праведност и съществуването на абсолютното добро и зло.
Този вътрешен конфликт се проявява чрез различни срещи и срещи, които Браун преживява по време на пътуването си, всяка от които допринася за нарастващото му безпокойство и съмнение. Той трябва да се изправи пред възможността, че е способен на зло и че границата между доброто и злото не е толкова ясна, колкото е вярвал преди.
В крайна сметка, абстрактният конфликт в „Младият Гудман Браун“ е за изследването на главния герой на по-тъмните аспекти на човешката природа, границите на собствения му морал и борбата да запази вярата си пред лицето на съмнението и изкушението.