Алвин: Д-р Робърт Балард беше главният учен при множество гмуркания на дълбоководната подводница Alvin, която е собственост и се управлява от WHOI. Алвин е бил използван за изследване на широка гама от подводни среди, включително останките на Титаник, хидротермални отвори и дълбоководни коралови рифове. Балард използва Алвин, за да проведе много от най-известните си проучвания, включително откриването на хидротермални извори на източния тихоокеански възход и останките на Титаник.
NOAA Okeanos Explorer: Д-р Робърт Балард е главен изследовател в Националната администрация за океаните и атмосферата (NOAA) Okeanos Explorer, програма, която използва автономни подводни превозни средства (AUV) и ROV за изследване на океана. Балард е участвал в няколко експедиции на Okeanos Explorer, включително скорошна експедиция за изследване на останките на USS Indianapolis в Тихия океан.
В допълнение към тези проекти, д-р Робърт Балард също е участвал в редица други изследователски и изследователски проекти, включително:
* Експедицията Deepsea Challenger, която през 2012 г. отведе Балард до най-дълбоката точка в океана, Challenger Deep в Марианската падина.
* Търсенето на Амелия Ърхарт, проект за намиране на останките от самолета на Амелия Ърхарт, изчезнал през 1937 г.
* Черноморският морски археологически проект, който търси останки от кораби в Черно море.
* Проектът LOST 52, който търси останките от подводници на американския флот, изгубени по време на Втората световна война.