Ето какво знаем за неговата музикална продукция:
* Той беше предимно църковен музикант. Това вероятно е причината повечето от неговите композиции да са предназначени за религиозни служби, като кантати, мотети и произведения за орган.
* Смята се, че е написал няколко кантати и хорала. За съжаление нищо от тях не е запазено.
* Той също написа няколко пиеси за клавишни инструменти. Някои от тях все още са запазени, включително „Allein Gott in der Höh sei Ehr“ и „Christ lag in Todesbanden“, които се считат за ранни примери за барокова органна музика.
Изключително важно е да запомним, че познанията ни за творчеството на Йохан Кристоф Бах са много ограничени поради липсата на оцелели ръкописи. Следователно е невъзможно да се предостави изчерпателен списък на неговите композиции.
Въпреки това, оцелелите произведения предлагат ценна представа за музикалната среда, в която Йохан Себастиан Бах е израснал и е бил повлиян.