Другите му романи включват:
* Цикълът Портата на смъртта (1990-1994)
* Книгата на черната земя (1995)
* Книгата на бялата роза (1996)
* Книгата на червеното слънце (1997)
* Празнотата (2000)
* Сферата (2001)
* Хоризонтът (2002)
* Воалът (2003)
* Разделението (2005)
* Пръстенът (2007)
* Стената (2008)
Неговите разкази включват:
* "The Last of the Winnebagoes" (1987)
* "Формата на нещата" (1989)
* "The Hunter's Moon" (1991)
* "Сянката на бурята" (1992)
* "Кладенецът на мрака" (1993)
* "The Doom of Dragonstar" (1994)
* "Съдбата на боговете" (1995)
* "Краят на вечността" (1996)
* "Денят, в който Земята спря" (1997)
* "The Last Question" (1998)
Неговите колекции включват:
* *Уилям Е. Уотърс:In the Balance* (1991)
* *Уилям Е. Уотърс:Последният от Winnebagoes и други истории* (1993)
* *Уилям Е. Уотърс:Формата на нещата и други истории* (1995)
* *Уилям Е. Уотърс:Луната на ловеца и други истории* (1997)
* *Уилям Е. Уотърс:Сянката на бурята и други истории* (1999)
Уотърс също е написал няколко книги за младежи, включително:
* Изгубените земи (2000-2003)
* Сянката на боговете (2005)
* Последният от елфите (2007)
* Възходът на Тъмния лорд (2009)
* Битката на титаните (2011)
* Зората на древните (2013)
* Падането на Атлантида (2015)
Уотърс печели множество награди за работата си, включително Световната награда за фентъзи за Най-добър роман за Гневът на Тиамат и наградата Locus за Най-добър фентъзи роман за The Crystal Shard . Той е член на Американските писатели на научна фантастика и фентъзи и Асоциацията на писателите на ужаси.