* Томас и неговите приятели Миньо, Нют и Тереза най-накрая успяват да избягат от страховития лабиринт.
* Те научават истината за истинската си цел:да служат като субекти в жесток експеримент, проведен от WCKD, организацията, създала и контролирала Лабиринта.
* Тереза разкрива своята вярност към WCKD, оставяйки Томас с разбито сърце и под въпрос на кого може да се довери.
* Групата, сега бегълци, се впуска в опасно пътешествие през Scorch, пуста и коварна пустош, в търсене на митичното безопасно убежище, място, където могат да се освободят от лапите на WCKD.
* По пътя те се сблъскват с многобройни предизвикателства, включително безмилостни Cranks, жестоки бури и вечно присъстващата заплаха от Създателите.
* В крайна сметка те стигат до Safe Haven, само за да открият, че това не е това, на което са се надявали. Това е временно убежище, контролирано от друга фракция, която също се стреми да ги използва за собствените си цели.
* Томас, Миньо и Нют научават истината за Flare, смъртоносната болест, която опустоши света. Те осъзнават, че държат ключа към намирането на лек, благодарение на уникалния си имунитет.
* С новооткрита решителност те решават да се изправят срещу WCKD и да сложат край на управлението на терора веднъж завинаги. Те се впускат в последна мисия, прониквайки в щаба на WCKD, за да разкрият тайните на организацията и да освободят онези, които са били затворени и върху които са правени експерименти.
* В климатична битка Томас и приятелите му преодоляват множество препятствия, изправяйки се пред най-дълбоките си страхове и жертвайки всичко за по-доброто на човечеството.
* В крайна сметка те успяват в своята мисия, сваляйки WCKD и осигурявайки бъдеще, в което хората могат да живеят свободни от лапите на манипулацията и потисничеството.