Флейтата също има ключова система, която позволява на свирача лесно и бързо да отваря и затваря тоналните отвори. Тази ключова система се състои от поредица от лостове и пръти, които са свързани към отворите за звука. При натискане на клавиш той отваря съответния отвор за тон, а при отпускане на клавиш затваря съответния отвор за тон.
Чрез промяна на дължината на въздушната колона и отваряне и затваряне на тоналните отвори, флейтистът може да произвежда широк диапазон от ноти. Най-ниската нота, която една флейта може да произведе, е До под средното До, а най-високата нота, която една флейта може да произведе, е До три октави над средното До.