Най-ранните бонго вероятно са разработени от поробени африканци в Куба, които са ги използвали, за да правят музика и да изразяват себе си. С течение на времето бонго се превърнаха в основен продукт на кубинските музикални жанрове като сон, румба и салса. Те бяха приети и от други латиноамерикански страни и в крайна сметка се разпространиха по целия свят.
Бонго барабаните изиграха значителна роля в развитието на различни музикални стилове, включително джаз и латино джаз. В началото на 20 век бонго са въведени в джаз музиката от известни перкусионисти като Чано Позо и Тито Пуенте. Те стават популярен инструмент в различни джаз групи и допринасят за сливането на джаз и латино ритми.
В Съединените щати бонго печелят популярност през 50-те и 60-те години на миналия век като част от експлозията на латино музиката. Те са включени в музиката на изпълнители като Тито Пуенте, Мачито и Селия Круз. Bongos също намериха своето място в рок и поп музиката, където бяха използвани за добавяне на перкусивен елемент към песните.
Днес бонго остават основен инструмент в много музикални жанрове, включително латино музика, джаз и различни форми на популярна музика. Те обикновено се използват в ансамбли за ударни инструменти и също така са включени в музикални образователни програми по света.
Историята на бонго барабаните е доказателство за тяхната гъвкавост, изразителност и способност да обединяват хората чрез музика. Те са символ на културен обмен, творчество и богатите традиции на афро-кубинската музика.