Mewtwo може да се намери само в дълбините на Cerulean Cave. Mewtwo е невероятно трудно да се победи, ако не сте добре подготвени. Първо се уверете, че сте хванали поне 40 покемона, преди да влезете в пещерата. Ще ви трябват множество силни покемони от високо ниво, за да победите различните покемони в пещерата. Освен това не забравяйте да се запасите с много отвари Hyper и Max.
За да стигнете до пещерата Cerulean, първо посетете Pokemon Center на път 24 точно над Fuchsia City. Говорете с жената, която седи на масата отдясно, веднага щом влезете и тя ще ви попита дали искате да гледате слайдшоу за пещерите. Отговорете с „да“ и тя ще ви покаже няколко слайда. След слайдшоуто тя ще ви даде карта на града, изобразяваща местоположението на Cerulean Cave. Вземете тази карта и я покажете на полицая вляво от центъра. След като му покаже вашата карта, офицерът ще ви пусне да преминете. Насочете се към път 25, който е портата над път 24.
Сърфирайте по водата и ще стигнете до малък остров с друг офицер, седнал отляво. Той няма да ви пусне да преминете, докато не спечелите осем значки за фитнес. След като вземете 8-ма значка за фитнес, върнете се към път 25. Офицерът ще се премести и сега можете да продължите към пещерата Cerulean.
Преди да влезете в пещерата Cerulean, подгответе екипа си. Уверете се, че имате покемон, който знае Surf и покемон, който може да научи Flash (като Magnezone). Когато сте готови, влезте в пещерата Cerulean и използвайте Flash. Започнете да бягате напред по пътеката, като избягвате дивите покемони, които се появяват периодично. Продължете, докато стигнете до езерце; използвайте Surf, за да прекосите езерото и да кацнете покрай брега от другата страна.
Продължете по тази пътека, докато стигнете до разклонение. Тръгнете по лявата пътека и вървете по-нататък, докато попаднете на друго разклонение с две пътеки. Поемете по правилния път и продължете, докато стигнете до друго езерце. Сърфирайте в езерото и кацнете на брега от другата страна. Веднага щом излезете на сушата, погледнете надолу и ще видите Mewtwo в яма под краката си. Ако искате да хванете Mewtwo, не забравяйте да намалите HP, без да го победите. Когато здравето му е достатъчно ниско, хвърлете Ultra или по-добра топка, за да го хванете.
Ако победите Mewtwo, то ще изчезне завинаги. Mewtwo няма да се появи отново в Cerulean Cave, нито можете да го намерите другаде.