Точната причина за смъртта му е неизвестна, но се смята, че е била сърдечен удар Поради суровите условия той издържаше. Той е намерен мъртъв близо до палатката си, а тялото му е погребано под снежен изрифт.
Важно е да се отбележи, че теорията на Wegener за континенталния дрейф, която той предложи през 1912 г., не е широко приета през живота си. Той умря сравнително непознат учен, но неговата новаторска теория в крайна сметка се оказа вярна и сега се счита за една от най -важните фигури в историята на геологията.