- "Защо кръстът?" (1901) :
Това е най-известната му творба, която представя богословската обосновка за разпъването на Исус Христос и как то означава Божията любов и благодат.
- „The Battleground of the Soul:A Study in the Science of Sanctification“ (1903) :
Тази книга изследва духовното пътуване на християнина и как вярващите трябва да се стремят към лична святост и победа във вътрешните си борби.
- „Тайната на един щастлив ден“ (1904) :
Тази книга има за цел да вдъхнови хората да намерят щастие и удовлетворение, като се доближат до Бог и прегърнат живот на духовна трансформация.
- „Животът, който печели“ (1906) :
Тази работа подчертава важността на жизнения и победоносен християнски живот, подчертавайки необходимостта от силна вяра и последователно отдаване на Божията воля.
- „Ключът на кралството“ (1907) :
В тази книга Джонстоун разяснява ученията на Исус Христос и подчертава значението на личното ученичество и живота според Божиите заповеди.
- „Сигурният път на спасение“ (1909) :
Тази работа предоставя ясно и кратко обяснение за това как хората могат да получат спасение чрез вяра в Исус Христос.
- „Божието величие“ (1919) :
Тази книга се задълбочава във величието и суверенитета на Бог, като се фокусира върху Неговите качества и как те влияят на човешкото разбиране и поклонение.
- „Кръстът и неговото значение“ (1930) :
Джонстън преразглежда значението на Христовото разпятие и изяснява неговите многостранни последици за човешкото спасение и помирението с Бог.
Това са някои от видните писания на Джон Чалмърс Джонстън, демонстриращи неговата богословска дълбочина и духовното въздействие, което е имал върху много читатели през годините.