Точният механизъм зад менструалния синхрон все още е неясен и изисква допълнителни изследвания. Някои теории предполагат, че феромоните, химически сигнали, освободени от тялото, могат да играят роля в подреждането на менструалния цикъл на жените в непосредствена близост. Научната общност обаче не е постигнала консенсус относно съществуването или основните причини за менструалния синхрон.