1. Правителствена конспирация :Първоначално Борн е бил добре обучен убиец от ЦРУ, известен като "Дейвид Уеб". Въпреки това, след като измамна операция се обърка, той получи амнезия и стана цивилен без спомен за миналото си. ЦРУ и други правителствени агенции се стремят да го елиминират, за да прикрият тайните на програмата Тредстоун, таен проект за черни операции, който създаде Борн и други убийци като него.
2. Blackbriar :Blackbriar е организация наследник на Treadstone, създадена от бивши служители на ЦРУ. Те искат да контролират Борн и да използват уменията му за собствените си тайни операции. Борн обаче се превръща в заплаха за плановете им поради независимия си характер и риска от разкриване на дейността им.
3. Кирил и руското правителство :В някои случаи действията на Борн влизат в конфликт с интересите на руското правителство, по-специално на героя Кирил. Кирил е високопоставен офицер от руското разузнаване, който иска да отмъсти на Борн за минали действия, които включват смъртта на близки. Той смята Борн за личен враг и се стреми да го елиминира.
4. Лична вражда :Докато Борн разкрива истината за миналото си и заговорите около него, той се натъква на хора, които развиват лична вендета срещу него. Тези хора може да са бивши колеги или врагове, които се чувстват предадени или онеправдани от действията на Борн, което ги мотивира да търсят отмъщение.
Важно е да се отбележи, че причините за желанието да убиете Борн варират в зависимост от конкретните сюжетни линии на книгите или филмите от поредицата за Борн и не всички от тези причини може да присъстват във всяка история.