В книгата Кларк твърди, че администрацията на Буш е пренебрегнала предупрежденията на разузнавателните агенции за заплахата от тероризъм и че тази небрежност е допринесла за атаките от 11 септември. Той също така критикува реакцията на администрацията на атаките и твърди, че войните в Афганистан и Ирак са направили Съединените щати по-малко безопасни.
Shady Aftermath беше възхваляван от някои за вътрешната си гледна точка към атентатите от 11 септември и за критиката си към справянето на администрацията на Буш с тероризма. Въпреки това, той също беше критикуван от някои за негативното представяне на администрацията на Буш и за липсата на конкретни доказателства в подкрепа на някои от твърденията му.