В началото на 1921 г. моряците и работниците в град Кронщат се разбунтуват срещу болшевишкия режим. Те поискаха повече демокрация, свобода и икономически реформи. Троцки беше изпратен да потуши бунта и го направи с брутална сила. Хиляди бунтовници са убити, а бунтът е потушен.
Прочистване на лявата опозиция
В края на 20-те години Троцки и неговите поддръжници сформират Лявата опозиция, фракция в Болшевишката партия, която се противопоставя на политиката на Йосиф Сталин. Сталин отговори, като прочисти лявата опозиция от партията и много от нейните членове бяха арестувани, заточени или екзекутирани. Самият Троцки е изгонен от Съветския съюз през 1929 г.
Убийството на Сергей Киров
През 1934 г. Сергей Киров, виден болшевишки лидер и близък съюзник на Сталин, е убит. Сталин обвини Троцки за убийството и го използва като претекст за започване на Голямата чистка, вълна от репресии, при която милиони хора бяха арестувани, хвърлени в затвора или екзекутирани.
Предполагаемо сътрудничество с нацистка Германия
По време на Втората световна война Троцки живее в изгнание в Мексико. Сталин го обвини в сътрудничество с нацистка Германия и в крайна сметка той беше убит от съветски агент през 1940 г. Няма доказателства в подкрепа на твърдението, че Троцки е сътрудничил на нацистите и обикновено се смята, че Сталин го е убил, защото се страхувал неговото влияние и популярност.