Бутикът е проектиран от приятеля и артистичен сътрудник на Бийтълс, Саймън Постума, който също е проектирал обложките на албумите им и други рекламни материали. Той е предназначен да бъде търговски обект за стоки, свързани с Бийтълс и други изпълнители, свързани с Apple Records, включително дрехи, аксесоари и стоки за дома.
Магазинът беше известен със своя цветен и психеделичен декор, който отразяваше естетиката от края на 60-те години. Той също така включва артикули, проектирани от самите Бийтълс, като тениски, шалове и бижута.
Въпреки това, Apple Boutique се изправи пред предизвикателства от самото начало, включително липса на управленски опит, лошо финансово управление и конкуренция от други магазини. Бийтълс също срещнаха трудности с наема на имота и разногласия между тях и техните съветници относно посоката на магазина.
В резултат на това Apple Boutique затваря през август 1968 г. след само една година работа. Бийтълс понасят значителни финансови загуби от начинанието и затварянето на магазина бележи края на прякото им участие в търговията на дребно.