Филми:
* Розови фламинго (1972): Уотърс изигра ролята на "Божественото" в този култов класически филм.
* Desperate Living (1977): Той също се появи като "Божественото" в този филм.
* Полиестер (1981): Уотърс играе ролята на "The Divine" и също режисира този филм.
* Лак за коса (1988): Уотърс имаше епизодична роля като продавач в магазин за плочи в този филм.
* Cry-Baby (1990): Той се появи за кратко като директор на училище.
* Серийна майка (1994): Уотърс играе ролята на "Божественото" в този филм.
* Пекър (1998): Той отново се появи като "Божествения" в този филм.
* Мръсен срам (2004): Уотърс играе ролята на "Божественото" в този филм.
* Този мръсен свят (2006): Той се появява в този документален филм за неговия живот и работа.
* Станция Fruitvale (2013): Уотърс се появява епизодично като новинарски репортер.
* Къщата, която Джак построи (2018): Уотърс играе малка роля в този филм на Ларс фон Триер.
Телевизия:
* Семейство Симпсън (1991): Уотърс изрази себе си в епизода "Homer Defined".
* Южен парк (1997): Той също така се изрази в епизода "Chef Aid".
* Семейство Сопрано (2001): Уотърс имаше епизодична роля като режисьор в епизода "Синята комета".
* Задържано развитие (2003): Той имаше малка роля в епизода "The Immaculate Election".
* Шоуто на Лари Сандърс (1992-1998): Уотърс направи няколко изяви като себе си в това шоу.
* Грозната Бети (2006-2010): Той се появи като себе си в епизода "Светът на грозната Бети".
* RuPaul's Drag Race (2010-настояще): Уотърс се е появявал многократно като гост съдия в това шоу.
Докато изявите му в други проекти са ограничени, Джон Уотърс е най-известен със собствените си уникални и въздействащи филми.