Филми:
* Смело сърце (1995) - като "Морис"
* The Boondock Saints (1999) - като "Murphy MacManus"
* Snatch (2000) - като "Brick Top"
* Гладиатор (2000) - като "Цицерон"
* The Boondock Saints II:Ден на всички светии (2009) - като "Murphy MacManus"
* Smokin' Aces (2006) - като "Дариус"
* The Last Stand (2013) - като "Burnett"
* Пазители на галактиката (2014) - като "Fin Fang Foom" (глас)
* Синове на анархията (2014) - като "Филип "Чибс" Телфорд" (кредитиран като "Томи Фланаган")
* Ледения човек (2014) - като "Професорът"
* Последното лице (2016) - като "Джак"
* Големият Лебовски (1998) - като "Ultraman" (нерегистриран)
* Сакото (2005) - като "Don" (нерегистриран)
* Тримата мускетари (2011) - като "Rochefort" (нерегистриран)
Телевизия:
* Синове на анархията (2008-2014) - като "Филип "Чибс" Телфорд"
* Щитът (2004-2008) - като "Томи"
* Американците (2013) - като "Аркадий Иванов"
* Американски богове (2017-2021) - като "The Technical Boy"
* Mays M.C. (2018-настояще) - като "Филип "Чибс" Телфорд"
* Westworld (2016-настояще) - като "Мартин Конълс"
* The Expanse (2015-2022) - като "Camina Drummer"
* „Зоната на здрача“ (2019) - като "Човекът"
* "The Witcher" (2023) - като "Мартин"
Това не е изчерпателен списък, но включва някои от най-забележителните му роли. Той също така е имал роли в други телевизионни предавания и филми, както големи, така и независими.
Томи Фланаган е уважаван актьор, известен със силното си и често заплашително присъствие на екрана.