Ранна кариера:
* Разбиване на вълните (1996): Нейната пробивна роля, която й носи номинация за Оскар за най-добра актриса.
* Хилари и Джаки (1998): Изобразява брилянтната, но проблемна цигуларка Жаклин дю Пре.
* Боксерът (1997): Романтична драма, развиваща се в Северна Ирландия.
* Пепелта на Анджела (1999): Играе майката в тази адаптация на мемоарите на Франк Маккорт.
По-късна кариера:
* Червен дракон (2002): Трилър по романа на Томас Харис.
* Животът и смъртта на Питър Селърс (2004): Игра съпругата на Питър Селърс.
* Войната на световете (2005): Научнофантастичен филм с участието на Том Круз.
* Момичето в кафенето (2005): Политическа драма, развиваща се в Брюксел.
* Тайният живот на пчелите (2008): Драма за младо момиче, което бяга, за да намери майка си.
* Крадецът на книги (2013): Историческа драма за младо момиче в нацистка Германия.
* Еверест (2015): Играе ролята на Хелън Уилтън.
* Фарът (2019): Психологически филм на ужасите с Уилям Дефо.
* Електрическият живот на Луис Уейн (2021): Играе ролята на Емили Ричардсън.
* The King's Man (2021): Предистория на филмовата поредица Kingsman.
Други забележителни филми:
* The Escapist (2008): Криминална драма.
* Ана Каренина (2012): Филмова адаптация по романа на Лев Толстой.
* Моята седмица с Мерилин (2011): Биографична драма за Мерилин Монро.
* Изгубената дъщеря (2021): Психологическа драма с участието на Оливия Колман.
Това е само извадка от впечатляващата филмография на Емили Уотсън. Тя продължава да бъде активна и аплодирана актриса, с още много проекти зад гърба си.