* Зародишна теория за болестта: Изследванията на Пастьор доказват, че микроорганизмите, а не "лошият въздух" или спонтанното генериране, причиняват заболяване. Това беше революционна концепция, която преобрази медицинската наука.
* Пастьоризация: Той разработи процеса на нагряване на течности за убиване на вредни бактерии, сега известен като пастьоризация. Това се използва широко днес в хранително-вкусовата промишленост.
* Ваксинация: Пастьор разработва първите ваксини срещу бяс и антракс. Работата му полага основите на съвременните стратегии за ваксиниране.
* Ферментация: Той изучава ролята на микроорганизмите във ферментацията, което води до напредък в пивоварната, винопроизводството и млечната промишленост.
Въпреки че основният му фокус беше върху горните области, работата му засегна и други области:
* Химия: Пастьор е бил обучен като химик и е провел значителни изследвания в областта на кристалографията и стереохимията.
* Обществено здраве: Неговата работа допринесе изключително много за общественото здраве чрез развитието на ваксинациите и разбирането на предаването на болестта.
Като цяло Луи Пастьор е пионер в микробиологията и имунологията, чийто принос продължава да оказва влияние върху нашето разбиране за болестите и здравето.